在药物开发的早期阶段,寻找novel scaffolds化合物是一项重要但具有挑战性的任务。目前已经提出了各种模型来产生药物样分子,然而这些模型设计具有novel scaffolds化合物的wet-lab验证和靶特异性分子的能力几乎没有得到验证。最近,四川大学华西医院的研究团队在期刊《Nature Communications》(IF=17.694)上发表题为“Generative deep learning enables the discovery of a potent and selective RIPK1 inhibitor.”的文章,提出了一种生成式深度学习(GDL)模型,一种分布学习条件递归神经网络(cRNN),用于为给定的生物靶标生成定制的虚拟化合物库。然后将GDL模型应用于RIPK1。对生成的特制化合物库进行虚拟筛选和随后的生物活性评估,发现了一种有效的选择性RIPK1抑制剂,具有以前未报道的scaffolds RI-962。该化合物在保护细胞免于坏死方面显示出有效的体外活性,并且在两种炎症模型中显示出良好的体内功效。这些发现证明了研究工作者的GDL模型在利用未报道的scaffolds生成hit/lead化合物方面的能力,突出了深度学习在药物发现中的巨大潜力。
本文中使用了欣博盛Mouse TNFα, IL-6, and IL-1β ELISA kits检测了结肠组织匀浆样本中这些细胞因子的含量。
1.文章题目:Generative deep learning enables the discovery of a potent and selective RIPK1 inhibitor.
期 刊:Nature Communications(影响因子:17.694)
发表时间:12 November 2022
作 者:Li Y, Zhang L, Wang Y, et al.
作者单位:四川大学华西医院
使用产品:Mouse TNFα, IL-6, and IL-1β ELISA kits
样本类型:结肠组织
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36371441/
2.文章题目:Molecular mechanisms of interrod spacing-mediated osseointegration via modulating inflammatory response and osteogenic differentiation.
期 刊:Chemical Engineering Journal(影响因子:16.744)
发表时间:11 November 2022
作 者:Yu M, Yang H, Li B, et al.
作者单位:西安交通大学
使用产品:Mouse IL-1β, IL-4, IL-10 and TNF-α ELISA kits
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1385894722056212
3.文章题目:Excessive IL-10 and IL-18 trigger hemophagocytic lymphohistiocytosis–like hyperinflammation and enhanced myelopoiesis.
期 刊:Journal of Allergy and Clinical Immunology(影响因子:14.29)
发表时间:9 November 2022
作 者:Tang Y, Xu Q, Luo H, et al.
作者单位:华中科技大学同济医学院
使用产品:Human IL-10, IL-18, IL-2Ra ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35792218/
4.文章题目:Preparation, characterization and immunomodulatory effects of unsaturated sulfated oligoguluronic acid.
期 刊:Carbohydrate Polymers(影响因子:10.723)
发表时间:21 November 2022
作 者:Bi D, Huang J, Cao J, et al.
作者单位:深圳大学
使用产品:Mouse IL-6 and TNF-α ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36446502/
5.文章题目:Rational design of a genome‐based insulated system in Escherichia coli facilitates heterologous uricase expression for hyperuricemia treatment.
期 刊:Bioengineering & Translational Medicine(影响因子:10.684)
发表时间:21 November 2022
作 者:He L, Tang W, Huang L, et al.
作者单位:中科院武汉病毒研究所
使用产品:Mouse IL-1β, rat IL-6 ELISA kits
样本类型:肾脏组织
https://aiche.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/btm2.10449
6.文章题目:Co‐delivery of dendritic cell vaccine and anti‐PD‐1 antibody with cryomicroneedles for combinational immunotherapy.
期 刊:Bioengineering & Translational Medicine(影响因子:10.684)
发表时间:27 November 2022
作 者:Chang H, Wen X, Li Z, et al.
作者单位:中国科学院大学
使用产品:Mouse IL-6 and IFN-γ ELISA kits
https://aiche.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/btm2.10457
7.文章题目:Recombinant protein diannexin prevents preeclampsia-like symptoms in a pregnant mouse model via reducing the release of microparticles.
期 刊:Frontiers of Medicine(影响因子:9.927)
发表时间:4 November 2022
作 者:Guo H, Zhang Y, Chu Y, et al.
作者单位:北京大学第三医院
使用产品:Human IL-1β ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36331793/
8.文章题目:Mettl14-mediated m6A modification enhances the function of Foxp3+ regulatory T cells and promotes allograft acceptance.
期 刊:Frontiers in immunology(影响因子:8.786)
发表时间:1 November 2022
作 者:Liu Y, Yuan Y, Zhou Z, et al.
作者单位:电子科技大学
使用产品:Mouse IL-10, TGF-β, IL-2 and IFN-γ ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36341394/
9.文章题目:Lactate-driven macrophage polarization in the inflammatory microenvironment alleviates intestinal inflammation.
期 刊:Frontiers in Immunology(影响因子:8.786)
发表时间:1 November 2022
作 者:Zhou H C, Yu W W, Yan X Y, et al.
作者单位:兰州大学第二临床医学院
使用产品:Mouse TNF-α ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36330516/
10.文章题目:Polysaccharide from Atractylodes macrocephala Koidz. ameliorates DSS-induced colitis in mice by regulating the Th17/Treg cell balance.
期 刊:Frontiers in immunology(影响因子:8.786)
发表时间:1 November 2022
作 者:Yang M, Zhang Q, Taha R, et al.
作者单位:中国药科大学
使用产品:Mouse TNF-α ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36341374/
11.文章题目:Delamanid suppresses CXCL10 expression via regulation of JAK/STAT1 signaling and correlates with reduced inflammation in tuberculosis patients.
期 刊:Frontiers in Immunology(影响因子:8.786)
发表时间:8 November 2022
作 者:Qiao M, Li S, Ren W, et al.
作者单位:首都医科大学
使用产品:Human CXCL10 ELISA Kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36426362/
12.文章题目:Development of Nectin4/FAP-targeted CAR-T cells secreting IL-7, CCL19, and IL-12 for malignant solid tumors.
期 刊:Frontiers in Immunology(影响因子:8.786)
发表时间:21 November 2022
作 者:Li F, Zhao S, Wei C, et al.
作者单位:温州医科大学
使用产品:Human CCL19 ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36479116/
13.文章题目:Porphyromonas gingivalis infection promotes inflammation via inhibition of the AhR signalling pathway in periodontitis.
期 刊:Cell Proliferation(影响因子:8.755)
发表时间:29 November 2022
作 者:Hao T, Zhang R, Zhao T, et al.
作者单位:南京大学医学院
使用产品:Mouse IL-6, IL-1β and TNF-α ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36446468/
14.文章题目: Multifunctional Nanoparticles-Mediated PTT/PDT Synergistic Immune Activation and Antitumor Activity Combined with Anti-PD-L1 Immunotherapy for Breast Cancer Treatment.
期 刊:International Journal of Nanomedicine(影响因子:7.033)
发表时间:16 November 2022
作 者:Kong C, Xu B, Qiu G, et al.
作者单位:广西医科大学
使用产品:Mouse IL-6, IL-12, TNF-α, IFN-γ, TGF-β and IL-10 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36419717/
15.文章题目:Deubiquitylase PSMD14 inhibits autophagy to promote ovarian cancer progression via stabilization of LRPPRC.
期 刊:Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Basis of Disease(影响因子:6.633)
发表时间:1 November 2022
作 者:Zhao Z, Xu H, Wei Y, et al.
作者单位:中国医学科学院
使用产品:Annexin V-FITC/PI apoptosis assay kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36328147/
16.文章题目:SIGIRR deficiency contributes to CD4 T cell abnormalities by facilitating the IL1/C/EBPβ/TNF-α signaling axis in rheumatoid arthritis.
期 刊:Molecular Medicine(影响因子:6.376)
发表时间:18 November 2022
作 者:Teng X, Mou D C, Li H F, et al.
作者单位:四川大学华西医院
使用产品:Mouse TNF-α ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36401167/
17.文章题目:Mallotucin D, a Clerodane Diterpenoid from Croton crassifolius, Suppresses HepG2 Cell Growth via Inducing Autophagic Cell Death and Pyroptosis.
期 刊:International Journal of Molecular Sciences(影响因子:6.208)
发表时间:17 November 2022
作 者:Dai X, Sun F, Deng K, et al.
作者单位:清华大学
使用产品:Human IL-1β ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36430694/
18.文章题目:iNKT17 cells play a pathogenic role in ethinylestradiol-induced cholestatic hepatotoxicity.
期 刊:Archives of Toxicology(影响因子:6.168)
发表时间:4 November 2022
作 者:Kong W, Li X, Zou M, et al.
作者单位:中国药科大学
使用产品:Mouse CXCL10 ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36329302/
19.文章题目:Regulation of Yujin Powder alcoholic extracts on ILC3s-TD IgA-colonic mucosal flora axis of DSS-induced ulcerative colitis.
期 刊:Frontiers in microbiology(影响因子:6.064)
发表时间:1 November 2022
作 者:Wen Y, Zhang W, Yang R, et al.
作者单位:甘肃农业大学
使用产品:Mouse TNF-α, IL-6, IL-1β, IL-10 and IgA ELISA kits
样本类型:结肠组织
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36338041/
20.文章题目:Proteomics analysis reveals novel insights into the mechanism of hepatotoxicity induced by Tripterygium wilfordii multiglycoside in mice.
期 刊:Frontiers in pharmacology(影响因子:5.988)
发表时间:17 November 2022
作 者:Miao Y, Zhang Q, Yuan Z, et al.
作者单位:中国药科大学
使用产品:Mouse IgA ELISA kit
样本类型:粪便
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36467101/
21.文章题目: An mRNA-based rabies vaccine induces strong protective immune responses in mice and dogs.
期 刊:Virology Journal(影响因子:5.913)
发表时间:12 November 2022
作 者:Li J, Liu Q, Liu J, et al.
作者单位:珠海Liverna医疗用品有限公司
使用产品:Mouse IL-4 and IFN-γ ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36371169/
22.文章题目:Novel Bisamide Alkaloids Enantiomers from Pepper Roots (Piper nigrum L.) with Acetylcholinesterase Inhibitory and Anti-Neuroinflammatory Effects.
期 刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry(影响因子:5.895)
发表时间:30 November 2022
作 者:Wang Y X, Xu Z Y, Qin S Y, et al.
作者单位:沈阳药科大学
使用产品:Mouse IL-1β ELISA kit
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36450093/
23.文章题目:Characterization of Novel Exopolysaccharides from Enterococcus hirae WEHI01 and Its Immunomodulatory Activity.
期 刊:Foods(影响因子:5.561)
发表时间:7 November 2022
作 者:Jia K, Wei M, He Y, et al.
作者单位:南昌大学
使用产品:Mouse TNF-α and IL-6 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36360150/
24.文章题目:In Vitro Effect of Flavonoids on Basophils Degranulation and Intestinal Epithelial Barrier Damage Induced by ω-5 Gliadin-Derived Peptide.
期 刊:Foods(影响因子:5.561)
发表时间:29 November 2022
作 者:Wu S, Zhang R, Liu Y, et al.
作者单位:南昌大学药学院
使用产品:Human IL-6 and TNF-α ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36496664/
25.文章题目:The flavonoids extract from Okra flowers protects against DSS-induced colitis via regulating NF-κB signaling pathway and gut microbiota.
期 刊:Journal of Functional Foods(影响因子:5.223)
发表时间:14 November 2022
作 者:Huang X, Li X, Deng Y, et al.
作者单位:四川大学华西公共卫生学院
使用产品:Mouse IL-6, TNF-α and IL-1β ELISA kits
样本类型:结肠组织
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1756464622004054
26.文章题目:Huanglian Jiedu plaster ameliorated X-ray-induced radiation dermatitis injury by inhibiting HMGB1-mediated macrophage-inflammatory interaction.
期 刊:Journal of Ethnopharmacology(影响因子:5.195)
发表时间:19 November 2022
作 者:Wang J, Xie K, Ren W, et al.
作者单位:西南医科大学
使用产品:Mouse IL-1β and IL-6 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36414215/
27.文章题目:Interleukin-27 Ameliorates Atherosclerosis in ApoE-/-Mice through Regulatory T Cell Augmentation and Dendritic Cell Toleranc.
期 刊:Mediators of Inflammation(影响因子:4.529)
发表时间:11 November 2022
作 者:Xu W, Zhu R, Zhu Z, et al.
作者单位:华中科技大学同济医学院
使用产品:Mouse TGF-β, IFN-γ, and IL-17 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36405994/
28.文章题目:Chitosan-functionalized graphene oxide as adjuvant in HEV P239 vaccine.
期 刊:Vaccine(影响因子:4.169)
发表时间:9 November 2022
作 者:Bai Q, Wang Z, Yina A N, et al.
作者单位:中国农业大学
使用产品:Mouse TNF-α, IFN-γ, IL-1β and IL-10 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36371365/
29.文章题目:Sox9 is required in regeneration of pancreatic β cells following injury.
期 刊:Experimental Cell Research(影响因子:4.145)
发表时间:1 November 2022
作 者:Wang Q, Chen J, Han J, et al.
作者单位:贵州医科大学
使用产品:山羊抗兔IgG-HRP
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36332684/
30.文章题目:Gab1 Overexpression Attenuates Susceptibility to Ventricular Arrhythmias in Pressure Overloaded Heart Failure Mouse Hearts.
期 刊:Cardiovascular Drugs and Therapy(影响因子:3.947)
发表时间:14 November 2022
作 者:Liu M, Zhao J, Lu Y, et al.
作者单位:岳阳市中心医院
使用产品:Mouse TNF-α, IL-6 and IL-1β ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36374360/
31.文章题目:Study on the expression of TRIM7 in peripheral blood mononuclear cells of patients with sepsis and its early diagnostic value.
期 刊:BMC Infectious Diseases(影响因子:3.667)
发表时间:19 November 2022
作 者:Lu M, Ma A, Liu J, et al.
作者单位:扬州大学
使用产品:Human TNF-α, IL-6 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36402943/
32.文章题目:Low Curcumin Concentrations Combined with Blue Light Inhibits Cutibacterium Acnes Biofilm-induced Inflammatory Response through Suppressing MAPK and NF-κB in Keratinocytes.
期 刊:Photodiagnosis and Photodynamic Therapy(影响因子:3.577)
发表时间:17 November 2022
作 者:Zheng N, Zhou M, He Y, et al.
作者单位:中国医学科学院
使用产品:Human TNF-α, IL-6 and IL-8 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36403927/
33.文章题目:Methyl 2-naphthoates with anti-inflammatory activity from Morinda officinalis.
期 刊:Fitoterapia(影响因子:3.204)
发表时间:17 November 2022
作 者:Wang C, Wei Q H, Xin Z Q, et al.
作者单位:济南大学
使用产品:Mouse TNF-α and IL-6 ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36403943/
34.文章题目:Protective Effects of Lactobacillus reuteri on Intestinal Barrier Function in a Mouse Model of Neonatal Necrotizing Enterocolitis.
期 刊:American Journal of Perinatology(影响因子:3.079)
发表时间:11 November 2022
作 者:Lai Z, Gong F.
作者单位:重庆医科大学
使用产品:Mouse TNF-α and IL-1β ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36368653/
35.文章题目:Autophagy-related 9 homolog B regulates T-cell-mediated immune responses in oral lichen planus.
期 刊:Archives of Oral Biology(影响因子:2.64)
发表时间:24 November 2022
作 者:Tan Y Q, Zhang J, Zhou G.
作者单位:武汉大学
使用产品:Human TNF-α, IL-4 and IFN-γ ELISA kits
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36442338/
36.文章题目:Nestin prevents mesenchymal stromal cells from apoptosis in LPS-induced lung injury via inhibition of unfolded protein response sensor IRE1α.
期 刊:Life Medicine(影响因子:1.806)
发表时间:4 November 2022
作 者:Wang H, Jiang C, Cai J, et al.
作者单位:中山大学
使用产品:Mouse IL-1β, TNF-α, IFN-γ and IL-6 ELISA kits
样本类型:肺泡灌洗液
https://academic.oup.com/lifemedi/advance-article-abstract/doi/10.1093/lifemedi/lnac049/6795954